内陆城市也有妈祖庙的，例如湖南芷江天后宫、贵州镇远天后宫等。多为闽商引进，或从事水运工作的商人建造祈福的。
芷江天后宫位于湖南怀化市芷江侗族自治县境内，是中国内陆最大的妈祖庙，建于明代。1748年，福建客商在会馆原址上重新修建天后宫，其规制就已经是今天的样子。庙宇占地面积约3700平方米，现存建筑面积1970平方米，整体呈坐西朝东走向，有“江南第一坊”之称。
镇远天后宫位于贵州省黔东南镇远县古城内，北靠石屏山，南临舞阳河，是海洋文化深入苗岭深山规模最大、最险、最高的妈祖庙。
会泽县天后宫位于云南省曲靖市会泽县，是云南省曲靖市会泽会馆建筑群之一，清乾隆元年(1736)筹资修建，占地3000平方米，原为林氏家庙，此后移民会泽的福建人将其逐渐变成福建会馆。
太谷天后圣母庙位于山西省太谷县山西农业大学校园内的“崇圣楼”，此处原为太谷孟家花园的旧址，当年为保孟家江淮商业水上运输安全而建。
山东台儿庄天后宫建于清雍正年间，奉祀“天后”妈祖，毁于战火，2009年在原址重建。妈祖信仰跟随闽商的脚步传到了这里，它的存在是闽商在大运河流域经商、传播妈祖信仰的见证，也反映出当年台儿庄舟船云集、经济繁荣的盛况。
玉林妈祖庙在玉州区名山街道绿杨社区，残存着一座建于明代的妈祖庙，为玉林市文物保护单位。玉林的妈祖庙与移民和海上丝绸之路有关，古代玉林的货物通过南流江运往沿海城市，为祈求航运平安，人们修建了天后宫。
